L'effetto dell'accoppiamento  spin-spin può essere eliminato mediante una tecnica chiamata "disaccoppiamento“. L'effetto del disaccoppiamento consiste nel mascherare la presenza di un particolare gruppo di protoni, quali ad es. i protoni He raffigurati nell'illustrazione sull'etilbenzene. Si acquisisce così uno spettro come se i protoni He fossero assenti! Ciò si ottiene trasmettendo una sequenza di impulsi di disaccoppiamento alla frequenza di risonanza f_e dei protoni He, cambiando così costantemente l'orientamento di rotazione di questi protoni. Per lo spettro illustrato nella figura dello spettro dell'etilbenzene, la frequenza di disaccoppiamento sarebbe superiore di 1,25 ppm al picco TMS.

 Gli impulsi di disaccoppiamento tendono ad essere più lunghi e di potenza inferiore rispetto agli impulsi di eccitazione. Nell'illustrazione sottostante viene rappresentato un esperimento di disaccoppiamento, mentre nella figura dello spettro di etilbenzene con disaccoppiamento protonico è illustrato lo spettro risultante. Il quartetto CH₂ è diventato ora un  singoletto. Gli esperti di spettroscopia parlano di collasso da quartetto a singoletto. Inoltre, l'area sottostante il singoletto dovrebbe essere equivalente a quella del quartetto originale (paragonare le relative altezze dei picchi di CH₂ e dell'anello di benzene nelle due figure). Il segnale del gruppo CH₃ a 1,25 ppm manca nello spettro di disaccoppiamento, perché gli impulsi di disaccoppiamento eliminano di fatto gli effetti della presenza dei protoni CH₃.

L'esperimento sopra descritto è un esempio di disaccoppiamento omonucleare, in quanto lo stesso isotopo, ¹H, viene osservato e disaccoppiato.  Si ha invece un disaccoppiamento eteronucleare quando l'isotopo da osservare è diverso dall'isotopo disaccoppiato. Nel capitolo Spettro 13C con disaccoppiamento del protone di questo manuale, viene effettuato un disaccoppiamento eteronucleare in cui si osserva l'isotopo ¹³C e si disaccoppia l'isotopo ¹H. Gli spettrometri AVANCE con SGU hanno la capacità di effettuare esperimenti molto complessi, in base al numero dei canali installati. Uno spettrometro a quattro canali può essere usato per osservare un nucleo e disaccoppiare altri tre nuclei. Avendo fino a otto canali indipendenti, la gamma possibile di esperimenti è a dir poco sorprendente. L'utente dovrebbe essere consapevole del fatto che, attualmente, il fattore limitante non è la generazione di un'eccitazione RF e degli impulsi di disaccoppiamento bensì la trasmissione di tali impulsi al campione mediante le sonde e, in una certa misura, mediante i preamplificatori. Il percorso del segnale dell'esperimento da eseguire viene impostato mediante il menù "edasp“. Per ulteriori dettagli si rinvia al manuale “Acquisition Commands and Parameters” (Comandi e parametri di acquisizione, P/N H9775SA3).