El efecto del acoplamiento espín-espín  se puede eliminar mediante una técnica llamada “desacoplamiento ”. El efecto del desacoplamiento es enmascarar la presencia de un determinado grupo de protones, por ejemplo, los protones He en la figura del etilbenceno. ¡Se adquiere un espectro como si los protones He no estuvieran! Esto se logra mediante la transmisión de una secuencia de pulsos de desacoplamiento a la frecuencia de resonancia fe de los protones He y cambiando de este modo la orientación de espín de estos protones de forma permanente. Para el espectro del etilbenceno mostrado en la figura anterior, la frecuencia de desacoplamiento sería de 1.25 ppm en relación al pico del TMS.

Los pulsos de desacoplamiento  tienden a ser más largos y de menor intensidad que los pulsos de excitación. En la figura de desacoplamiento, que se muestra a continuación, se representa el experimento de desacoplamiento, mientras que la figura siguiente muestra el espectro desacoplado. El cuadruplete del CH₂ se transforma ahora en un singlete. Los espectroscopistas lo expresan diciendo que el cuadruplete colapsa en un singlete. Observe que el área del singlete  debe ser igual al área del cuartete original (compare las alturas relativas de los picos del CH₂ y del anillo de benceno en las dos figuras). La señal del grupo CH₃ a 1.25 ppm no aparece en el espectro desacoplado, debido a que los pulsos de desacoplamiento eliminan eficazmente los efectos de la presencia de estos protones.

El experimento descrito arriba es un ejemplo de homodesacoplamiento donde el mismo isótopo, es decir el ¹H, tanto se observa como se desacopla. El heteroacoplamiento se produce cuando el isótopo que se observa es diferente al que se desacopla. En el capítulo Espectro de 13C con desacoplamiento de protón de este manual realizaremos un experimento de heterodesacoplamiento donde se observa ¹³C y se desacopla ¹H. Los espectrómetros AVANCE con SGU tienen la capacidad para llevar a cabo experimentos muy complicados en función del número de canales instalados. Con un espectrómetro de cuatro canales se puede observar un núcleo y desacoplar otros tres tipos de núcleos. Con hasta ocho canales independientes el rango de experimentos posibles es sorprendente. El usuario debe saber que actualmente el factor limitante no es la generación de pulsos de RF de excitación y de desacoplamiento, sino la transmisión estos pulsos a la muestra mediante la sonda, y hasta cierto punto los preamplificadores. El recorrido de la señal en el experimento a realizar se ajusta utilizando el menú "edasp“. Más detalles se pueden encontrar en el manual “Comandos y parámetros de adquisición” (P/N H9775SA3).