Kompensacja  jest procesem, w którym wprowadza się niewielkie korekty pola magnetycznego, aż jego  jednorodność (równomierność) zostanie zoptymalizowana. Zwiększenie jednorodności  ma korzystny wpływ na rozdzielczość widmową. Przy każdej zmianie sondy lub próbki konieczne jest wykonanie ponownej kompensacji. Jeśli odpowiednie wartości kompensacji zostaną zapisane przez osobę odpowiedzialną za system (w tak zwanych plikach kompensacji) dla każdej sondy, znacznie zmniejszy się niezbędny czas kompensacji przy zmianie sondy.