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Choix du solvant
Après purification et séchage de l'échantillon, l'étape suivante consiste à choisir un solvant adéquat. Puisque le deutérium est le noyau de verrouillage le plus courant, l'échantillon est généralement dissous dans un solvant deutéré (un solvant deutéré est un solvant dans lequel une proportion élevée, de l'ordre de 99 %, des atomes d'hydrogène est constitué par du deutérium). Bien qu'il existe de nombreux solvants, les solvants deutérés  généralement utilisés sont les suivants : chloroforme-d, dimethylsulfoxyde-d6, benzène­d6, acétone­d6. Les facteurs à prendre en considération lors du choix d'un solvant sont les suivants  :
1.
Solubilité :   plus l'échantillon est soluble, meilleur est le solvant. Cela maximise la totalité de l'échantillon dans le volume utile, ce qui augmente la sensibilité de l'expérience.
2.
Interférence des signaux du solvant avec ceux de l'échantillon : le solvant lui­-même va inévitablement produire des signaux de RMN qui vont masquer des régions du spectre. Idéalement ces « pics de solvant résiduel » ne devraient pas se chevaucher avec les signaux de l'échantillon.
3.
Dépendance de la température :  pour les expériences qui se déroulent au-dessus ou en dessous de la température ambiante, les points de fusion et d'ébullition du solvant sont des facteurs importants. Par ailleurs, la solubilité de l'échantillon est susceptible de varier en fonction de la température.
4.
Viscosité : plus la viscosité du solvant est faible, meilleure est la résolution du spectre .
5.
Coût : pour les routines de RMN impliquant de nombreux échantillons à mesurer, le facteur coût du solvant joue un rôle important. En règle générale, le prix augmente avec le nombre d'atomes deutérés.
6.
Teneur  en eau : presque tous les solvants RMN contiennent des traces d'eau. Parmi les solvants RMN, certains sont également hygroscopiques (ils absorbent l'eau de l'atmosphère), donc plus leur durée de stockage est longue, plus ils contiennent d'eau. La présence d'un pic d'eau (HDO) aura pour effet de dégrader la qualité des spectres RMN. Il est possible de réduire considérablement le niveau de l'eau dans le solvant en le filtrant à travers un agent siccatif ou en ajoutant un tamis moléculaire lors du stockage du solvant.
Le choix du solvant pour un échantillon particulier sera le meilleur compromis entre les avantages et les inconvénients que présente chaque solvant. Pour de plus amples détails sur les solvants spécifiques, une recherche par Internet est conseillée.