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Esta unidad puede ser pequeña (NanoBay), simple (OneBay) o doble (TwoBay), dependiendo principalmente del sistema, y alberga la mayoría de las cajas del hardware electrónico asociado a un espectrómetro digital moderno. Las unidades principales son el IPSO   (Organizador de secuencia de pulso inteligente), el BSMS   (Sistema de imán inteligente Bruker), la VTU   (Unidad de temperatura variable), así como diversos amplificadores.
IPSO: Las diversas unidades incluidas en el IPSO generan los pulsos de radiofrecuencia empleados para excitar la muestra y reciben, amplifican y digitalizan las señales de RMN emitidas por la muestra. Una vez los datos son recibidos y digitalizados, la información se transfiere al ordenador anfitrión para transformaciones posteriores y almacenamiento. La conexión principal con el ordenador anfitrión es vía Ethernet. Es importante resaltar que el IPSO tiene el control total sobre el funcionamiento del espectrómetro a lo largo de la duración del experimento. De esta forma se asegura un funcionamiento ininterrumpido y se garantiza la integridad de la adquisición. El rack contiene un conjunto de tarjetas tipo ranura de entrada digital y analógica, que preparan la señal para ser transmitida y también reciben, amplifican y digitalizan la señal de RMN. Una descripción detallada de estas tarjetas va más allá del ámbito de este manual.
BSMS: Este sistema se controla vía software (comando ‘bsmsdisp‘) y se utiliza para hacer funcionar el sistema de bloqueo de campo (lock) y de homogeneización (shims), así como para controlar la sustentación y el giro de la muestra.
VTU: Dependiendo del modelo la VTU puede ser una unidad separada y autónoma, o puede estar incorporada en la BSMS. Su función es cambiar la temperatura de la muestra de forma controlada o mantenerla a un valor constante.
Amplificadores  (conocidos también como transmisores ): A menudo, para excitar la muestra de RMN, se requieren señales de una amplitud relativamente grande y de ahí la necesidad de amplificadores. Los amplificadores pueden ser internos (incorporados en el rack IPSO) o externos (unidades separadas y autónomas). Los cables que van directamente desde las salidas del amplificador hasta el preamplificador HPPR   (High Performance Preamplifier ) transportan la señal RF a la muestra. Aunque hay disponible un amplio rango de amplificadores (incluyendo amplificadores para sólidos), las dos categorías principales son:
Amplificadores selectivos  (conocidos también como amplificadores 1H o de protón), que están específicamente diseñados para amplificar las altas frecuencias asociadas con 1H y 19F.
Amplificadores de banda ancha  (conocidos también como amplificadores X), que están diseñados para amplificar un amplio rango de frecuencias (excluyendo 1H y 19F).
Entrada del glosario: BSMS
El sistema de imán inteligente Bruker (Bruker Smart Magnet control System = BSMS) proporciona un control computarizado de las diferentes funciones asociadas al imán, el campo del imán y la muestra.
Entrada del glosario: VTU
Unidad de temperatura variable
Entrada del glosario: HPPR
Preamplificador de altas prestaciones (High Performance Preamplifier)
Entrada del glosario: IPSO
Organizador de secuencia de pulso inteligente (Intelligent Pulse Sequence Organizer)